Globalement, la gestion du FED se fait a travers un systeme qui comprend l'Ordonnateur Principal, au niveau des services de la commission; L'Ordonnateur Regional, le Chef de la Delegation du pays accrédité et l'Ordonnateur National.

• L’Ordonnateur Principal du FED , est le premier personnage de la Commission Européenne chargé de l’aide humanitaire et du développement et qui est responsable de la gestion des ressources du Fonds Européen de Développement. En ce sens, «  il est responsable des engagements, du contrôle, de l’autorisation et de la comptabilité des dépenses financées sur le Fonds ».
  
• Le Chef de Délégation est le représentant de la Commission Européenne en Haïti. En plus de partager la cogestion des Fonds FED avec l’Ordonnateur National, Il gère les affaires générales de la Commission et aussi ses fonds propres de même que les lignes budgétaires ;
  
• L’Ordonnateur National du FED en Haïti est le représentant des pouvoirs publics nationaux pour des activités financées sur le Fonds Européen de Développement. Il est l’interface du Chef de Délégation de la Commission Européenne en Haïti avec qui il assure la cogestion au niveau national, dans les mêmes termes que l’Ordonnateur Principal ;
  
• L’Ordonnateur Regional s'occupe de la gestion des Fonds regionaux.
  

L'Ordonnateur National est assisté dans sa fonction par un organe d'exécution : le Bureau de l"ordonnateur National.